Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CckarO08786 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CckarO08786 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CckarO08786 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms