Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms