Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms