Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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