Protein–RNA interactions for Protein: J3QMN6

Fmo6, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo6J3QMN6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fmo6J3QMN6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fmo6J3QMN6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms