Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem200cJ3QK46 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms