Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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