Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod3E9QA62 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms