Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf169E9Q7F2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms