Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms