Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms