Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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