Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Crlf1Q9JM58 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.5 ms