Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cabp1Q9JLK7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp1Q9JLK7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms