Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Nectin3Q9JLB9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Nectin3Q9JLB9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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