Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms