Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms