Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc130Q9D516 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc130Q9D516 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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