Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms