Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syf2Q9D198 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms