Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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