Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epdr1Q99M71 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms