Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms