Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1aQ99L02 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms