Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms