Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp3Q91W36 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms