Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms