Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh13Q8CEE7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms