Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Zbed4Q80WQ9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Zbed4Q80WQ9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Zbed4Q80WQ9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Zbed4Q80WQ9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Zbed4Q80WQ9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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