Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme8Q715T0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms