Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ssxb10Q6XAR7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ssxb10Q6XAR7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ssxb10Q6XAR7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb10Q6XAR7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb10Q6XAR7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb10Q6XAR7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ssxb10Q6XAR7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb10Q6XAR7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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