Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms