Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Ccdc18Q640L5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Ccdc18Q640L5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Ccdc18Q640L5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Ccdc18Q640L5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Ccdc18Q640L5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Ccdc18Q640L5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Ccdc18Q640L5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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