Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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