Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usf1Q61069 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usf1Q61069 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usf1Q61069 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usf1Q61069 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usf1Q61069 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms