Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms