Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms