Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa20Q45VN2 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms