Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm6899Q3USS0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms