Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ssbp4Q3U4B1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ssbp4Q3U4B1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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