Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms