Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cwc27Q3TKY6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cwc27Q3TKY6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms