Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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