Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms