Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms