Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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