Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms