Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms