Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms