Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms